Сериал "Душегубы" разворачивается на фоне позднего советского застоя. В 1984 году на московской квартире происходит убийство, и виновник, Николай Самойлов, скрывается с места преступления. Следователю Максиму Ковальскому удается выследить и задержать мужчину, доказав, что поймал опасного серийного преступника, долгое время остававшегося в тени.
Проходит пять лет, и Самойлов, проходящий лечение в стенах института Сербского, неожиданно исчезает. Его лечащий врач был убежден в излечении пациента, но реальность оказалась мрачнее. Почти сразу после победа в Подмосковье происходит шокирующее событие — рабочему завода присылают страшную посылку с угрозами его дочери. Картина преступления намеренно зловеща и заставляет вспомнить о старых делах.
Расследование поручают опытному следователю Леониду Ипатьеву, который вынужден объединить усилия с Ковальским. Им предстоит разобраться в путанице следов и мотивов, чтобы понять, вернулся ли старый призрак или в городе орудует новый, еще более изощренный убийца. Каждый шаг в этом деле ставит под сомнение не только профессионализм, но и личные убеждения тех, кто пытается докопаться до правды.